男生叫女生“憨憨”通常有以下几种含义：
爱的昵称：
表示男生对女生的喜爱，认为她诚实、可爱、有趣。
性格描述：
形容女生天真、单纯或幼稚，可能缺乏一定的理智和成熟度。
宠溺的称呼：
男生可能觉得女生在某些方面表现得傻傻的，很可爱，因此用“憨憨”来称呼她，表达一种宠溺和疼惜。
网络用语：
随着网络的发展，“憨憨”一词的含义有所演变，有时也用于形容人比较笨，但多数情况下是带有亲昵和玩笑的语气。
方言影响：
憨憨一词源自陕西方言，后来在网络上流行开来，成为了一种流行语。
综合来看，男生叫女生“憨憨”多数情况下是一种正面的、亲昵的称呼，表达的是男生对女生的喜爱和宠溺。当然，具体含义还需结合实际的语境和双方的关系来理解