郭瑀（生卒年不详），字元瑜，是东晋十六国时期敦煌郡人，属于当地的大族。他年少时好学，节操超人，青年时期游学至张掖，师从隐居在张掖东山的学者郭荷，并继承了其学问。郭瑀精通经义，擅长辩论，多才多艺，善于写作。在郭荷去世后，他为师守孝三年，并继承师业，在临松薤谷（今马蹄寺）开凿石窟，设馆讲学，并著有《春秋墨说》、《孝经综纬》等作品。
他曾拒绝前凉王张天锡和前秦皇帝苻坚的出山为官邀请，选择继续隐居生活。在东晋太元元年（376年），王穆在酒泉起兵反抗前秦时，曾联络郭瑀与敦煌索嘏在张掖起兵策应，并封他为左长史、军师将军。不过，后来王穆与索嘏不和，欲杀索嘏，郭瑀极力劝阻未果，最终因极度悲痛绝食而死