司法机关主要包括以下部门：
法院：
包括最高人民法院、地方各级人民法院和军事法院等专门人民法院，负责审判工作。
检察院：
包括最高人民检察院、地方各级人民检察院和军事检察院等专门人民检察院，负责法律监督。
公安机关 （含国家安全机关）：负责刑事案件的侦查、拘留、执行逮捕、预审等，同时承担社会治安管理职责。
司法行政机关：
管理监狱、律师、公证、人民调解和法制宣传教育等工作。
其他相关组织：
如律师组织、公证机关等，在司法活动中发挥辅助作用。
司法机关在狭义上主要指人民法院和人民检察院，但在广义上，还包括公安机关及其他负有刑事侦查权的机关。司法机关的职权主要包括审判权和检察权