科长与主任的职位大小 取决于具体机构和行政级别，不能一概而论。以下是详细分析：
公务员体系中的比较
在公务员体系中，科长通常是指某个科室的主管，属于领导职务，而主任通常是指主任科员，属于非领导职务。尽管两者都是正科级待遇，但科长的岗位职责通常高于主任。
具体来说，科长是领导级别的正科职位，而主任是非领导级别的正科职位。因此，在公务员体系中，科长通常比主任有更大的职权和责任。
医院体系中的比较
在医院体系中，主任通常指医院某科室的行政主任，而主任医师是职称名。主任医师的级别相当于医学院校的教授，部分主任医师同时也被评为“教授”职称。在这种体系下，主任医师的级别通常高于科主任。
企业中的比较
在企业中，科长通常属于中层管理干部，而主任的具体职位和级别则因公司而异。在某些企业中，科长可能相当于部门经理或主管，而主任可能是更高级别的管理职位或专业技术人员。
行政级别中的比较
在行政级别中，科长通常属于正科级，而主任的级别则因机构不同而异。例如，国务院办公厅的主任是正部级，而县政府的办公室主任是正科级。因此，主任的级别可能高于或低于科长，具体取决于所在机构的行政级别。
综上所述，科长与主任的职位大小不能简单地进行比较，需要结合具体的机构和行政级别来判断。在公务员体系中，科长通常比主任有更大的职权和责任；在医院体系中，主任医师的级别通常高于科主任；在企业中，科长和主任的职位和级别因公司而异；在行政级别中，主任的级别可能高于或低于科长。