《火影忍者》被一些观众认为“烂尾”的原因主要包括：
情节发展不合理
故事后期出现了许多逻辑漏洞，如主角鸣人和宇智波斑的战斗中，鸣人突然获得超越实力的能力，如六道模式，而没有合理的解释和铺垫。
某些情节中，原本应该逐步升级的挑战被简化为主角团与反派之间的直接对决，削弱了故事的紧张感和深度。
角色设定问题
后期一些重要角色如宇智波斑和辉夜的战斗表现与粉丝的期待不符，辉夜的战斗经验不足，未能体现出最终BOSS应有的实力。
角色之间的关系和剧情发展未能充分展现，导致一些角色如小李被边缘化，观众难以感受到他们的成长和变化。
作画质量下降
随着故事推进，画面的质量出现了明显的下滑，这影响了观众的观看体验。
主题和内涵处理不当
故事中涉及的主题过于宏大，如“战争与和平”，但在表现这些主题时显得表面化，未能深入挖掘。
某些情节中，主角通过“嘴遁”等非常规手段解决问题，被批评为剧情过于牵强。
剧情推进方法
为了快速完结，作者在一些剧情上采取了简化处理，如秽土转生的滥用，导致故事平衡被破坏。
配角表现不足
故事中许多配角的戏份减少，未能给观众留下深刻印象，与前期形成鲜明对比。
这些因素综合作用，导致《火影忍者》在故事的后半部分出现了许多观众不满意的地方，从而被一些粉丝认为“烂尾”。