自建房的层高选择需要考虑多个因素，包括地区、气候、个人喜好、建筑成本以及实用性等。以下是一些参考建议：
层高标准
根据《住宅设计规范》（GB50096-2011），普通住宅的层高宜为2.80米。
居室净高不应低于2.5米，以确保居住舒适度。
地区差异
北方地区：由于气候寒冷，层高不宜过高，以减少保温和采暖成本，建议一层约为3.3米，二层以上约为3.0米。
南方地区：夏季潮湿炎热，一层层高可以适当高一些，如3.6米，二层以上约为3.0-3.3米。
实用性考虑
如果房屋总高度是一层，建议高度是4米左右，以提供更大的使用空间。
对于农村自建房，一楼高度根据地区和需求可能有所不同，南方约3.2米，北方约3.5米。
层高过高的问题
制冷和采暖保温问题：层高过高会增加冷气或暖气需要覆盖的空间，导致能耗和费用增加。
成本问题：层高越高，建筑成本越高。
层高建议
一般每层的高度为3.2~3.5米，但考虑到造价因素，3米左右可能更为经济。
如果考虑增加客厅宽敞度，一层可以设置得稍高，如3.6米，但二层以上建议保持在3.0米左右。
请根据您的具体情况和偏好进行选择，并考虑上述因素。