当职工被诊断出患有职业病并被认定为工伤时，公司应按照以下标准进行赔偿：
治疗期间的工资福利：
在停工留薪期间，公司应正常支付员工的工资福利。
伤残津贴：
根据工伤的严重程度，员工可能会按月领取伤残津贴。
一次性伤残就业补助金：
在终止或解除劳动合同时，员工应享受一次性伤残就业补助金。
医疗费用：
包括治疗工伤的医疗费用和康复费用，以及住院伙食补助费、交通食宿费等。
生活护理费：
如果员工生活不能自理，经劳动能力鉴定委员会确认后，公司应支付生活护理费。
一次性伤残补助金：
根据工伤等级，员工可以获得一次性伤残补助金。
其他费用：
如安装配置伤残辅助器具所需费用等。
社会保险：
如果公司未为员工购买工伤保险，则需承担相应的工伤赔偿费用，包括补缴工伤保险费、滞纳金、工伤的医药费等。
退休待遇：
工伤职工达到退休年龄并办理退休手续后，可以享受基本养老保险待遇，如果基本养老保险待遇低于伤残津贴，由工伤保险基金补足差额。
具体的赔偿金额和程序应遵循当地劳动法规和工伤保险条例的规定，并考虑到员工的实际情况和所在地的相关标准。