皇帝的妹妹在古代中国被称为 公主。公主是皇族直系，皇帝的妹妹、女儿、姑姑、孙女都可称为公主。公主一般都有封号、封地，公主的封号一般有三种，以群县为名，如：平阳公主、平原公主、新城公主；以国为名，如：岐国公主、宁国公主；以美名称，如：文成公主、太平公主。
此外，皇帝的妹妹也可以称为 长公主。长公主是对中国古代皇室女子称呼，汉朝时地位等同于诸侯王，身份代表皇帝嫡长女或姐妹。自东汉之后，皇帝的女儿称为公主，姐妹称为长公主，姑母为大长公主，得宠的长公主位高于一般嫔妃。
建议根据具体的历史时期和文献来确定皇帝的妹妹的准确称呼。