郭圣通被废的原因是多方面的，主要包括以下几点：
政治联姻的破裂
刘秀最初与郭圣通的婚姻是出于政治考虑，为了巩固自己的地位。随着时间推移，刘秀的皇权逐渐稳固，不再需要依赖郭家的支持，导致政治联姻失去了意义。
皇后失德的传言
尽管没有确切的失德行为记录，但在当时宫廷政治中，皇后失德常作为废后的借口。刘秀可能为了巩固皇权，散布关于郭圣通的失德传言。
皇权中心思想的强化
刘秀强调皇权中心思想，认为皇帝应为国家最高统治者，后宫应服从皇帝意志。郭圣通作为皇后若拥有过高地位或权力，可能威胁皇权。
个人感情因素
皇帝与皇后之间可能因多种原因产生感情裂痕，这也是刘秀废后的一个潜在原因。
外戚专权的担忧
郭圣通背后的郭氏家族势力庞大，类似西汉的吕家和霍家。刘秀为了防止外戚专权，选择废黜郭圣通。
弥补原配
阴丽华是刘秀的原配，刘秀可能出于对她感情或弥补的目的，选择废黜郭圣通，并立阴丽华为后。
拉拢人心
郭圣通的出身和家族背景可能也是她被废的原因之一。刘秀可能认为立阴丽华能更好地拉拢人心。
权力的稳固
随着时间的推移，郭圣通的影响力可能已经不再重要，刘秀为了巩固自己的权力，选择废黜她。
郭圣通被废后，被封为中山王太后，并在建武十九年进一步被废为沛太后。她在被废后的11年里过着平静的生活，并最终安然去世