天津全运村存在的缺点包括：
交通拥堵和噪音问题：
全运村紧邻立交桥，车流量大，且有噪音干扰，对居住体验有较大影响。
步行道问题：
第二新华中学校园外四周步行便道路面不平整、局部破损严重，存在安全隐患，且全运村各小区外围四周步行便道也存在同样问题。
绿化问题：
全运村道路两侧的梧桐树病虫害严重，影响居住环境。
停车问题：
渌水道靠近师大二附小路段在早晚高峰期间道路拥堵严重，随意占路停车现象普遍，且渌水道和枫林路交口红绿灯未开启。全运村各小区外围四周道路上占路停车现象严重，道路变窄，影响市民通行。
配套设施不完善：
由于入住率不高，导致一些配套设施不能完善，例如幼儿园、小学、初中等教育设施缺乏。
物业服务问题：
有居民反映物业费偏高，且存在一些服务质量问题，例如开发商承诺的精装修存在偷工减料的情况。
非机动地上停放问题：
非机动地上停放有碍观瞻，塑胶跑道质量太差。
综上所述，天津全运村在交通、环境、配套设施和物业服务等方面存在一些明显的缺点，希望有关部门和居民能够共同努力，改善这些不足。