重庆的医药公司包括但不限于以下这些：
1. 重庆天圣药业有限公司
2. 重庆天圣制药股份有限公司
3. 重庆药友制药有限责任有限公司
4. 重庆市希尔安药业有限公司
5. 重庆三力制药有限公司
6. 重庆陪都药业有限责任公司
7. 重庆嘉陵化学制品有限公司
8. 重庆汉华制药有限公司
9. 重庆海洁消毒卫生用品有限公司
10. 重庆药物研究所制药厂
11. 重庆益发制药有限公司
12. 重庆北恩制药有限公司
13. 重庆飞亚实业公司
14. 重庆华特制药厂
15. 重庆江峡生化制药有限公司
16. 重庆康尔威药业股份有限公司
17. 重庆太极实业（集团）股份有限公司
18. 重庆市庆余堂制药有限公司
19. 重庆科瑞制药有限责任公司
20. 重庆庆龙药业有限公司
21. 重庆瑞鑫格中药饮片有限公司
22. 重庆时珍阁普生药业有限公司
23. 重庆市保元堂中药饮片有限责任公司
24. 重庆市京海中药饮片有限公司
25. 重庆市康万佳中药饮片有限公司
26. 重庆市林泉中药饮片有限公司
27. 重庆市万盛中药有限责任公司中药饮片加工厂
28. 重庆泰濠制药有限公司
29. 重庆同心制药有限公司
30. 重庆南松医药科技有限公司
31. 重庆庆全医药科技有限公司
32. 重庆昌熙医药科技有限公司
33. 太极集团重庆中药二厂有限公司
34. 重庆华立岩康制药有限公司
35. 重庆制药九厂
36. 重庆大自然制药有限公司
37. 重庆泰平药业有限公司
38. 重庆和平制药有限公司
39. 北大医药重庆大新药业股份有限公司
以上信息根据最近更新的数据整理而来，具体的公司情况可能会有所变化，建议联系相关企业或访问官方网站获取最新信息