低保户住院花费1万元的情况下，报销金额会根据医院等级和当地政策有所不同。以下是一般情况下的报销比例：
在镇卫生院就诊，报销比例约为40%。
在二级医院就诊，报销比例约为30%。
在三级医院就诊，报销比例约为20%。
此外，镇级合作医疗门诊补偿年限额通常为5000元。因此，如果是在镇卫生院就诊，1万元可以报销最高约6000元（10000元 * 40%），在二级医院约为5000元（10000元 * 30%），在三级医院约为4000元（10000元 * 20%）。
请注意，这些信息是基于过往的数据和规定，具体报销比例和金额应以当地最新的政策和规定为准。建议联系当地的社会保障部门或医疗保险机构获取最准确的信息