办理农村合作医疗的步骤如下：
个人申请
农村居民携带户口簿、二代居民身份证原件和复印件到户籍所在地村（居）委会提出参加农村医疗保险申请，选择缴费档次，填写《新型农村社会医疗保险参保登记表》一式二份。
村协理员检查
村协理员负责检查《参保登记表》、《农村户籍老年人家庭社会关系表》是否填写完整，填写的姓名、二代身份证号码等信息是否准确，是否有个人签字或盖章、按手印，检查参保人员提供的相关材料是否齐全，检查无误后，在《参保登记表》上签字，加盖村委会公章，附上参保人员本人居民二代身份证和户口簿复印件等材料，然后上报乡镇劳动保障事务所。
乡镇初审
乡镇劳动保障事务所对村里上报的参保登记有关材料进行初审，审核无误后，经办人员在《参保登记表》上签字，加盖乡镇保障所公章，及时将参保人员的基本信息录入新农保信息系统，将《参保登记表》、二代居民身份证和户口簿复印件等材料上报县农保中心。
县农保中心复核
县农保中心收到乡镇上报的参保登记有关材料及时进行复核，无误后，对乡镇劳动保障事务所录入的参保人员基本信息进行确认，为参保人员建立个人账户；在《参保登记表》签字、盖章，将有关材料归档备案。
缴纳保费
按照当地规定的缴费标准和时间，前往指定地点缴纳医疗保险费用。缴费方式可能包括现场缴纳、银行代扣等。
办理医疗保险证
办理完成后，会发放医疗保险证等证件，参保人员患病后持合作医疗卡到定点医院就医。
就医与报销
参保人员在本县各定点医院住院的，在办理住院手续时，到设在医院的“农医保专管员”处登记，“农医保专管员”会告知你一切所需手续。
参保人员到县外省内各定点医院住院治疗时，可直接去就医，出院后到农医保业务管理中心办理补偿。
参保人员到省外医院就医时，应先到农医保业务管理中心办理外出就医手续，特殊情况的可在住院的5天内到业务管理中心办理手续，未办理手续自行外出就医的，将按正常情况核算后的80%比例报销医药费。
建议：
提前了解当地的具体办理流程和要求，准备好所需材料。
尽量在规定的时间内完成缴费，避免影响保险待遇。
妥善保管好医疗保险证和相关材料，以便就医时能够顺利使用。