巨齿鲨的灭绝原因至今仍是科学界的一个未解之谜，但科学家们提出了一些可能的理论：
气候变化
巨齿鲨生活在亚热带海域，对温度和氧气的要求较高。白垩纪时期大气中的氧气含量急剧下降，可能无法满足巨齿鲨的需求。
全球气温的骤降导致海洋温度下降，巨齿鲨难以适应这种变化，导致其生存范围变小。
生态系统的改变
巨齿鲨主要以鲸类为食，随着两极海水变冷，鲸鱼迁移到更寒冷的水域，巨齿鲨因此失去了重要的食物来源。
海洋生态系统中的竞争加剧，例如巨齿鲨与大白鲨之间的竞争，可能也是导致其灭绝的原因之一。
食物链的变化
大约150万年前，地球的水循环出现变化，上升流减少，导致鲸类死亡和多样性减少，巨齿鲨因此找不到足够的食物而灭绝。
巨齿鲨的猎物（如鲸鱼）可能因为气候变化而数量减少，导致巨齿鲨的食物链崩溃。
其他因素
有研究提出巨齿鲨可能因为高新陈代谢和体温较高而容易灭绝，但这并没有得到广泛认可。
关于人类活动是否与巨齿鲨灭绝有关，目前并没有确凿的证据支持这一观点。
综合以上信息， 气候变化和生态系统的改变被认为是导致巨齿鲨灭绝的主要原因。尽管存在多种假设，但目前仍没有确凿的证据能够完全解释巨齿鲨的灭绝。