当您在申报个人所得税时遇到系统显示未申报的情况，可能的原因包括：
系统问题
个税系统可能正在进行升级，导致操作手册描述不清，操作错误。
服务器可能繁忙，系统反应不过来，造成查询结果未及时刷新。
数据同步问题
如果您在更换电脑或重装系统后申报个税，可能因为数据没有同步，导致之前的记录没有显示。
填报错误
申报信息填写错误或与税务机关记录的信息不一致，可能导致申报失败。
减免税明细表填写错误或比对不通过，例如减免税明细表发生额小于开票的不含税金额的某个百分比。
账户问题
您可能没有使用正确的个税账户登录，需要使用个税账户登录。
其他技术问题
网上申报可能没有保存成功，或者网上办税系统未及时更新。
人员信息采集不完整或数据校验不通过，专项附加扣除信息填写错误等也可能导致申报失败。
解决办法：
确认是否使用了正确的个税账户登录。
检查是否所有必要的信息都已经正确填写，并且没有违反税务法规。
尝试稍后重新查询，以等待系统刷新结果。
联系主管税务局或税务局客服获取帮助。
如果问题依旧，考虑数据备份、导入或迁移，并参照官网提供的操作手册进行操作。
请根据这些可能的原因进行排查，并采取相应的解决措施。