在选择航务局和航道局时，可以考虑以下几点：
工作性质
航务局通常涉及港口、航道等基础设施的建设与维护。
航道局专注于疏浚吹填等工作，以保持航道畅通。
待遇与福利
根据提供的信息，航务局的薪资和休假制度相对较好，有的单位提供完善的福利，如落户和宿舍。
航道局的工作可能较为辛苦，但待遇同样优厚，特别是在大型航道局如上航局。
发展前景
航务局的业务较为广泛，包括桥梁、铁路、公路等，相对稳定。
航道局随着疏浚技术的发展，工作量和需求可能会有所变化。
个人兴趣与职业规划
考虑自己的兴趣和职业规划，选择与自己专业背景和兴趣相符的单位。
研究生和博士毕业生可能更倾向于设计院等设计岗位，而本科生可能更适合施工单位。
地域因素
在大城市工作的收入可能相对较高，但在中小城市可能更为稳定。
某些航道局如天津、上海、广州的航道局，对于本科毕业生来说可能是一个较好的选择。
行业趋势
航务行业可能面临一些挑战，但总体上仍然是一个稳定的行业。
航道局的工作可能涉及上船，这需要考虑个人的适应能力和喜好。
综上所述，航务局和航道局各有优劣，选择哪个更好取决于个人的兴趣、能力、职业规划以及对工作环境和待遇的期望。建议在做决定前，详细了解每个单位的具体情况，并考虑自己的长期职业目标。