慈禧太后没有选择南逃的主要原因包括：
南方控制力弱：
自太平天国运动和捻军起义之后，清政府的传统军队无法有效镇压南方的叛乱，因此清政府鼓励汉人地方团练武装协助镇压，导致南方并不是清政府“逃难”的理想选择。
西方列强威胁：
南方诸省容易受到西方列强的威胁，历史上多次战争中，清政府的中央政府所在地都受到了来自北方或东南沿海的威胁，如鸦片战争和八国联军侵华战争。
东南互保协议：
在慈禧向八国联军宣战后，南方各省已经与西方列强达成了“东南互保协议”，即互不侵犯，这使得慈禧即使想逃往南方，也会遭到南方省份的抵制。
逃亡路线选择：
当时可供选择的逃亡路线有东北、南方和西部。慈禧最初考虑的是逃往山西太原，而非直接前往江南。
朝廷决策变化：
慈禧和光绪逃出北京时，最初计划是逃亡山西太原，并因应局势变化最终决定逃往西安。
因此，综合以上因素，慈禧太后没有选择南逃，而是选择了西行至西安