房屋加层是否违法取决于是否获得了政府相关部门的批准。以下是相关法律规定和考虑因素：
法律规定
根据《中华人民共和国城乡规划法》第六十四条，未取得建设工程规划许可证或者未按照建设工程规划许可证的规定进行建设的，属于违法行为。
如果业主在加层前已经向政府相关部门申请报批并且依法获得批准，则加层行为符合法律规定。
审批流程
业主若需变更房屋结构或规模，必须向城市、县人民政府城乡规划主管部门提出申请。
变更内容若不符合控制性详细规划，主管部门不得批准。
后果
如果未经批准擅自加层，县级以上地方人民政府城乡规划主管部门可责令停止建设，并处以罚款，严重者可拆除违建。
对于违法加建的建筑物，公民个人或社会组织可向政府相关部门投诉举报。
特殊情况
如果加层不影响他人正常生活、不妨碍城镇市容管理、不影响城镇统一规划，并且采取了必要的安全措施，可能不会追究责任。
总结来说，房屋加层是否违法主要看是否遵循了相应的审批程序和法律要求。未经批准擅自加层是违法的，可能会面临行政处罚或拆除违建等后果。