盛凡知识产权代理有限公司是否涉及诈骗行为，需要根据具体情况进行判断。根据您提供的信息，北京盛凡知识产权代理有限公司在广告中声称可以代理发明专利，并在不通过的情况下退款。然而，您委托该公司代办的两个发明专利未通过，公司拒绝退款。这种行为可能违反了消费者权益保护法，但并不能直接等同于诈骗。
诈骗通常指的是以非法占有为目的，通过虚构事实或隐瞒真相的方式，骗取他人财物的行为。如果北京盛凡知识产权代理有限公司在宣传中故意误导消费者，并且在合同中有明确的退款承诺，但在实际操作中不履行承诺，那么这种行为可能构成欺诈。
建议您收集所有相关的证据，包括合同、广告宣传材料、与公司的沟通记录等，并咨询专业律师或消费者保护机构，以便获得更准确的法律意见和帮助。