在处理职务侵占案件时，证据不足的情况可能由以下因素导致：
物证不足：
缺乏直接证据，如监控录像或物证，证实犯罪嫌疑人非法占有单位财物。
证人证言问题：
证言可能存在矛盾，或者不足以构成完整的证据链条。
书证不足：
财务账目、合同等未能清晰反映侵占行为。
口供不稳定：
犯罪嫌疑人口供与其他证据冲突，且未得到合理解释或排除。
鉴定意见问题：
鉴定意见含混不清或缺乏实质性关联性。
证据缺失：
行为人手段熟练，留下的证据少，或未能及时保留和收集证据。
口述证据不足：
行为人可能不轻易承认违法行为，依赖口述证据不可靠。
证据不全面：
受害者提供的证据可能未能全面揭示侵占行为。
尽管证据不足可能给案件处理带来困难，但仍有一些方法可以尝试获取更多信息或构建更有力的指控：
搜集间接证据：通过财务账目或交易记录等查看是否存在异常资金流转。
找到共同利益受害人：通过其他受害者的证言或参与增加指控可信度。
找到间接目击证人：寻找与职务侵占行为相关的间接目击证人。
寻求法律援助：通过专业律师帮助寻找证据或构建更有力的指控依据。
需要注意的是，即使证据不足，如果有事实材料证明犯罪事实确已发生，仍然可以立案。但是，最终证据不足是不能定罪的。