在离婚案件中，对于有两个孩子的判决，通常情况下，法院会考虑以下因素：
孩子的年龄和性别
两周岁以下的子女，一般随母亲生活，除非母亲存在不适宜抚养的情况。
两周岁至八周岁的子女，法院会综合考虑双方的经济状况、个人素质、生活环境、对子女的责任感以及与子女的感情亲密程度等因素，按照最有利于未成年子女的原则进行判决。
八周岁以上的子女，法院会尊重孩子的真实意愿。
父母的抚养能力和条件
法院会考虑父母的抚养能力、条件、意愿、与子女的亲厚程度、子女的生活环境和个人意愿等因素。
特殊情况
如果一方父母有意愿且有能力抚养两名子女，法院可能会判决抚养权归该方，以保障子女生活、学习和成长环境的稳定。
如果父母双方协议轮流抚养子女，并在法院的监督下达成协议，法院也会予以认可。
协商结果
如果夫妻双方能够就孩子抚养问题协商一致，可以按照双方的约定进行处理。
法律依据
《中华人民共和国民法典》第一千零八十四条规定，父母与子女间的关系，不因父母离婚而消除。离婚后，子女无论由父或者母直接抚养，仍是父母双方的子女。
经济责任
抚养费一般原则上，双方分别抚养一个时，互相不需要给抚养费；如果都是一方抚养，另一方需要每月给抚养费，原则是根据当地生活水平、小孩上学生活需要来定的。
综上所述，法院在判决时会以孩子的最佳利益为出发点，综合考虑各种因素，做出最合适的判决。如果双方无法协商一致，法院会根据具体情况，按照最有利于未成年子女的原则进行判决。