超算中心的收费方式通常有以下几种：
按小时计费
用户根据实际使用的计算资源和存储需求支付相应的费用。这种模式较为灵活，适用于不同规模和需求的使用场景。
预付费或包月方式
用户可以预先支付一定费用，然后根据使用的资源量进行计费，或者选择按月支付固定费用来获得一定的计算资源。
免费与付费结合
一些超算中心会提供部分免费计算资源，超过免费部分则需要付费使用。例如，武汉大学超级计算中心就提供了校内用户的免费计算资源，超过部分需要按实际使用的机时付费。
独占计算资源
用户可以付费租用某些计算节点以独占方式使用，无需参与其他用户排队申请计算资源。例如，武汉大学超级计算中心提供的付费独占计算主机方式，用户可以随时使用其租用的计算节点，费用按每节点16核计算。
排队计费
付费用户的作业与其他用户的作业一起参与排队，用户作业所需资源具备时开始运行，用户需要按照实际使用的机时（排队时间不计算在内）支付相关费用。例如，中国科学技术大学超级计算中心的收费标准中，付费排队价格根据不同的系统节点类型和配置有所不同。
配置和性能影响
收费标准通常受到用户所属机构、项目性质以及合作协议的影响。配置越高、性能越强的资源，单价通常也越高。例如，北京邮电大学超算平台基础集群的收费标准中，不同分区的收费标准根据配置（如CPU核数）有所不同，校内用户和校外用户的收费标准也有所区别。
建议
在选择超算中心时，建议详细咨询各中心的收费标准和服务条款，了解具体的计费方式、免费资源额度、独占资源租用流程等，以便更好地规划使用成本和预算。