食品中的致病菌主要包括以下几种：
沙门氏菌：
沙门氏菌是肠杆菌科的一个重要菌属，广泛存在于自然界中，可引起人类伤寒、副伤寒、感染性腹泻和食物中毒等症状。它主要污染动物性食品，包括禽畜类、蛋类、奶类及其制品等。
金黄色葡萄球菌：
金黄色葡萄球菌属于微球菌科葡萄球菌属，广泛存在于自然界中，包括空气、水、灰尘及人和动物的排泄物中。它能产生多种毒素，尤其是肠毒素，引起食物中毒，症状包括恶心、呕吐、腹痛、腹泻等。
副溶血性弧菌：
副溶血性弧菌是弧菌科弧菌属，主要存在于鱼、虾、蟹、贝类等水产品中，引起副溶血性弧菌食物中毒的食品主要是水产品，如腌制品等。
单核细胞增生李斯特氏菌：
单核细胞增生李斯特氏菌是革兰氏阳性短杆菌，广泛分布于土壤、地表水、污水、废水、植物、饲料、烂菜中。人主要通过摄入未经充分加热的冷冻食品尤其是肉类等而感染。
大肠埃希氏菌O157:H7：
大肠埃希氏菌O157:H7是肠出血性大肠杆菌家族中的一员，主要引起出血型腹泻，曾在一些国家由于加工食品被感染导致流行。
克罗诺杆菌属（阪崎肠杆菌）：
克罗诺杆菌属是近年来发现的一种致病菌，主要存在于婴儿食品中，可引起严重的感染和疾病。
炭疽杆菌：
炭疽杆菌属于芽孢杆菌属，主要引起食源性疾病，如炭疽病，通过食物传播。
霍乱弧菌：
霍乱弧菌是霍乱的病原菌，引起急性肠道传染病，发病急、传染性强、病死率高。
鼻疽杆菌 、 结核菌、 布氏杆菌、 猪丹毒杆菌：
这些细菌也可引起食物中毒或以食品为传播媒介，但相对较少见。
肉毒杆菌：
肉毒杆菌是一种生长在缺氧环境下的细菌，在罐头食品及密封腌渍食物中具有极强的生存能力，其分泌的肉毒毒素是已知的最剧毒物之一。
这些致病菌可通过加工生产、运输、储存等环节污染食品，人食用后可能引起食物中毒、肠胃疾病等。因此，食品生产、加工、销售等环节应严格遵守食品安全标准，确保食品的安全性。