黄猿在《海贼王》中并不是卧底。虽然有一些情节和细节可能让人怀疑他的真实身份，但根据《海贼王》的故事情节和角色发展，黄猿是海军大将，并且忠于他的职责和正义观念。他的一些行为，如对某些海贼的宽容和对其他海贼的严厉，可能看起来与他的身份不符，但这些都可以被解释为他的个人判断或是对特定情况的反应。
在《海贼王》的故事中，黄猿的行为和言论通常都与他作为海军大将的身份相符合，他执行任务时表现出极高的战斗力和对命令的绝对服从。此外，黄猿并没有直接证据表明他与革命军有联系，也没有表现出对革命军的亲近或支持。
因此，基于以上信息，可以得出结论，黄猿不是卧底，而是海军中的一位忠诚的大将