上海站和上海虹桥站的主要区别包括地理位置、服务的列车类型以及规模：
地理位置
上海站位于上海市静安区秣陵路303号，靠近市中心及长途汽车客运总站。
上海虹桥站位于上海市闵行区申贵路1500号，靠近虹桥综合交通枢纽，包括机场和汽车站。
服务的列车类型
上海站主要服务往北方的快车和部分高铁动车。
上海虹桥站主要服务高铁动车，没有普通快车服务。
规模
上海站站房总面积约为9.7万平方米，车场规模达到7台15线。
上海虹桥站总建筑面积约44万平方米，设有16站台、30股道，规模更大。
列车班次
上海站有高铁、动车、城际、特快和快速等多种类型的列车服务。
上海虹桥站以高铁为主，拥有更多的高铁班次。
两站之间距离大约为14.26公里，各自承担着不同的交通需求和功能。上海站作为市区的老站，以普通列车为主，而上海虹桥站作为新建的高铁车站，以高速列车为主，是华东地区重要的铁路客运枢纽