黄光裕入狱的原因主要包括以下几点：
非法经营罪：
黄光裕在2007年违反国家规定，非法买卖港币8.22亿余元。
内幕交易罪（操纵股价）：
作为北京中关村科技发展（控股）股份有限公司的实际控制人，黄光裕在资产重组、置换事项期间，指使他人使用其控制的账户购入公司股票，成交额累计人民币14.15亿余元，并从中获得账面收益约人民币3.09亿余元。
单位行贿罪：
在2006年至2008年间，黄光裕直接或指使他人给予多名国家工作人员款物，折合人民币456万余元，以谋取不正当利益。
根据上述罪行，黄光裕被判处有期徒刑14年，并处以罚金和没收个人部分财产。