过滤除菌操作通常包括以下步骤：
准备滤器
确保滤器已正确安装，进出口管路连接无误。
如果使用一次性滤头和无菌注射器，应确保它们已消毒。
冲洗滤器
使用清洁的水（如蒸馏水或反渗透水）冲洗滤器，通常冲洗水量为10-20L，循环系统约5分钟。
冲洗时，打开过滤器套筒顶部的排气阀和进出口阀门，启动输送泵，待排气阀有水流出时关闭排气阀，并排放最初约5L的出水。
高压灭菌
如果系统支持，可直接进行蒸汽灭菌或在高压釜中进行蒸汽灭菌。
在高压蒸汽釜中灭菌时，控制温度为121-125℃，至少持续30分钟。
注意下游出口的接管应联接好，并用牛皮纸包扎好出口，随滤器一起灭菌。
完整性试验
对消毒好的滤器进行完整性试验，以确保滤膜无破损。
试验指标依据滤柱包装中的说明书，例如0.22μm Durapore膜的起泡点压力为50Psi（3.45bar）。
使用滤器
通过完整性试验的滤膜可用于制品的除菌过滤。
开始过滤时，控制进口压力约为10-15Psi，随着滤膜堵塞，可适度提高压力以获得理想的流量，但最高压力应保持在3bar以下。
清洗滤器
使用后需要清洗滤柱，清洗剂可选择1%NaCl溶液或纯水。
可进行正向或反向清洗，但反向清洗时控制清洗压力不得超过2bar。
清洗后需用纯水冲洗至清洗剂不能检出，或pH值中性。
保存滤器
Durapore滤柱可保存在5%NaCl溶液中，并需定期更换保存液以保持其有效性。
以上步骤适用于大多数过滤除菌操作，但具体细节可能因滤器类型和用途而异。务必遵循滤器制造商提供的说明书和指导