根据提供的信息，从鼓浪屿返回厦门，推荐您选择三丘田码头下船。以下是几个原因：
交通便利：
三丘田码头靠近鼓浪屿的商业街区及各主要景点，方便游客游览和购物。
设施完善：
相比内厝澳码头，三丘田码头的配套设施更加完善，提供更好的交通和餐饮体验。
避免迷路：
内厝澳码头位于岛背后，若不熟悉岛内小路，容易迷路。从三丘田码头上岸后，左手走10分钟即可到达龙头路美食街，更加便捷。
夜间限制：
17:40以后，游客只能从三丘田码头下船，因此如果您计划在晚上返回厦门，三丘田码头是更合适的选择。
综上所述，三丘田码头是下船的最佳选择。