间接持股比例的计算通常涉及多个步骤，具体方法如下：
确定直接持股比例
首先，需要计算出投资者直接持有的股权占公司总股本的比例。
确定间接持股比例
如果投资者通过一家或多家境外公司持有最终被投资企业的股份，需要计算出通过每家境外公司间接持有的股份比例，并将它们相加。
合并直接和间接持股比例
将直接持股比例与间接持股比例相加，得到总的持股比例。
考虑特殊规则
在计算间接抵免持股比例时，税法中可能会有一些特殊规则和限制，比如持股时间的要求、持股比例的最低限制等，需要确保计算符合这些规则。
示例计算
假设股东A通过公司B间接持有公司C的股份，具体计算步骤如下：
公司B持有公司C的股权比例为X%。
股东A持有公司B的股权比例为Y%。
股东A对公司C的间接持股比例为X%乘以Y%，即（X% × Y%）。
例如：
公司B持有公司C 30%的股份。
股东A持有公司B 40%的股份。
股东A对公司C的间接持股比例为（30% × 40%） = 12%。
公式
间接抵免持股比例的公式如下：
\[ \text{间接抵免持股比例} = \text{直接持股比例} \times \text{间接抵免比例} \]
其中，直接持股比例是指投资者直接持有的股权占公司总股本的比例，间接抵免比例是指公司通过持有其他公司股权间接抵免税款的比例。
注意事项
在计算间接持股比例时，需要考虑所有中间层级的股权结构，并将每一层的持股比例相乘。
如果存在多个中间公司，需要逐层计算并相加。
税法中可能会有一些特殊规定，影响最终的计算结果，因此在计算时应仔细查阅相关税法规定。
希望以上信息对你有所帮助。