鳄鱼龟是杂食性动物，其食物来源广泛，主要包括：
动物性食物
小鱼、虾、贝类、瘦肉（牛肉、猪肉等）、动物内脏。
幼龟时期也会吃植物，如熟鸡蛋、熟小米混合物。
也会捕食无脊椎动物、两栖动物，甚至腐肉和蛇、鸟类。
植物性食物
虽然不是主要食物，但也会吃一些植物，如白菜、油菜、黄瓜、苹果、香蕉等。
合成饲料
成年后也可以投喂合成饲料，这种饲料营养丰富且不易污染水质。
喂食时应注意以下几点：
确保食物干净卫生，避免寄生虫和细菌感染。
适量投喂，一般三到五天喂一次，每次约为鳄鱼龟体重的5-10%。
对于幼龟，可以喂食小鱼虾和瘦肉丁，同时注意补充维生素A与维生素D。
饲养者也可以训练鳄鱼龟吃人工饲料