海南火车过海的时间主要受到火车拆分、装船、轮渡运输及重新拼接等多个环节的影响。根据最新的可靠信息，可以得出以下结论：
火车拆分与装船：
火车需要被分解成若干部分才能装进渡轮。这个过程大约需要半小时，期间火车无法供电。
轮渡运输：
装船完毕后，火车车厢会随渡轮一起过海。这个过程大约需要三个小时。
重新拼接：
到达对岸后，火车车厢需要重新拼接成完整的列车。这个过程也需要大约半小时。
综合以上环节，海南火车从广东海安北港码头到海口南港码头的全程大约需要 4.5小时。
因此，建议旅客在安排行程时，考虑到这个时间因素，以确保顺利到达目的地。