桔梗的死因主要与四魂之玉和奈落有关。以下是桔梗死亡的具体情况：
与犬夜叉的误会
桔梗和犬夜叉因四魂之玉而结缘，但在约定的日子里，发生了变故。被假犬夜叉袭击而受到重伤的桔梗，在背叛的愤怒中，用尽力气把犬夜叉封印在御神木上，然后带着四魂之玉在火焰中死去。
与奈落的战斗
桔梗在保护四魂之玉的过程中，被奈落设计，导致她与犬夜叉反目成仇。最终，桔梗在与奈落的战斗中，选择将生命化作了四魂之玉里最后一点光芒，这也成为了战胜奈落最后的希望，然后她从容赴死了。
被奈落贯穿
桔梗在追奈落的过程中，身体被奈落贯穿，最终推入瘴气池，这次她真的死了，犬夜叉为此痛哭。
综合以上信息，桔梗的死因主要是因为与奈落的战斗以及被其设计的误会，最终导致她带着四魂之玉在火焰中自尽，并化为碎片。她的死是《犬夜叉》中一个极为感人的悲剧，桔梗在最后的时刻仍然选择保护犬夜叉和四魂之玉，体现了她的高尚情操和悲剧英雄的形象。