无证驾驶摩托车会影响持有C1驾照的车主。根据《道路交通安全法》的规定，如果持有C1驾照的人无证驾驶摩托车，这属于“驾驶与准驾车型不符的机动车”的违法行为。一旦被交警查获，将面临以下处罚：
记12分：
根据《道路交通安全违法行为记分分值》第一条的规定，驾驶与准驾车型不符的机动车，将一次性记12分。
罚款：
根据《道路交通安全法》第九十九条，可能会被处以200元以上2000元以下的罚款。
拘留：
根据具体情况，可能会被处以15日以下的拘留。
扣留机动车：
公安机关交通管理部门将扣留机动车，并通知驾驶人提供相应的驾驶证。
需要注意的是，尽管无证驾驶摩托车不影响考C1驾驶证，但已经持有的C1驾照会因为上述违法行为被扣分，从而对C1驾照造成影响。因此，建议驾驶摩托车时应该持有相应的摩托车驾照