论文指导方式主要包括：
指导思路：
教师提供关于研究主题、问题、研究方法等方面的建议，帮助学生理清思路。
指定文献：
教师帮助学生找到相关文献，加深对研究领域的理解。
讨论研究思路：
教师与学生深入讨论研究问题的具体方向和方案，强化研究设计的合理性和可操作性。
提供反馈建议：
教师在论文写作的各个阶段审核并提供反馈、建议和修订意见。
设计实验方案：
教师指导学生设计实验方案，提供实验流程、材料、标准和步骤的指导。
启发学生独立思考：
教师仅对论文中的原则性问题进行指导，激发学生的积极性、主动性和创造性。
指导和督促进度：
教师监督学生撰写论文的具体进度，帮助学生克服写作中的困难。
论文修改和审阅：
教师指导学生修改论文，审阅并评定论文成绩。
指导论文答辩：
教师帮助学生准备论文答辩。
这些指导方式旨在确保学生能够独立思考、科学地进行研究，并撰写出高质量的学术作品。