建川博物馆聚落由多个主题博物馆组成，具体包括：
抗战系列
中流砥柱馆
正面战场馆
不屈战俘馆
飞虎奇兵馆
川军抗战馆
票证生活博物馆
兵器发展史博物馆
抗战文物博物馆
红色年代系列
瓷器馆
生活用品馆
章钟印馆
镜面馆
知青生活馆
中航工业航空三线博物馆
李振盛摄影博物馆
邓公祠
民俗系列
三寸金莲馆
老公馆家具馆
国防兵器馆
国防重兵器馆
长江漂流纪念馆
中医文物陈列馆
地震系列
震撼日记5.12-6.12馆
地震美术作品馆
5.12抗震救灾纪念馆
胡慧珊纪念馆
中国航海博物馆（虽然不属于建川博物馆，但与之相邻）
建川博物馆还包含其他一些专题展览和广场，如中国壮士群雕广场、抗战老兵手印广场等。博物馆占地500亩，建筑面积达到10余万平方米，拥有藏品一千余万件。