肯尼亚的主要城市包括：
内罗毕：
首都，全国政治、经济、文化、工业和交通中心。
蒙巴萨：
位于肯尼亚东部的港口城市，是滨海省省会，也是肯尼亚第二大城市。
基苏木：
位于肯尼亚西部的湖港，是尼安萨省首府，也是肯尼亚第三大城市。
埃尔多雷特：
位于肯尼亚西南部，是瓦辛吉舒高原中心，被称为长跑之乡。
恩布：
位于肯尼亚山南麓，是东方省首府。
涅里：
位于肯尼亚西南部，坐落在肯尼亚山与阿伯德尔山脉间，是中央省首府。
纳库鲁：
以纳库鲁湖国家公园而知名。
奈瓦沙：
以奈瓦沙湖和地狱之门国家公园而知名。
扎达尔：
以圣多纳特教堂和扎达尔城门而知名。
这些城市是肯尼亚较为重要的地区中心，具有不同的经济和文化特色