明朝时期，东厂和锦衣卫都是皇帝直接领导的特务机构，负责监察官员、收集情报、镇压叛乱等。它们在权力结构上有所不同，但都具有极大的权力。
东厂：由宦官领导，直接听命于皇帝，主要负责监控朝廷百官、掌握政治动态、镇压叛乱等。东厂成立初期直接向皇帝汇报，不受其他政府部门制约，行动隐秘，权力在锦衣卫之上。
锦衣卫：最初由明太祖朱元璋设立，直接听命于皇帝，是一个军事性质的特务机构，负责皇宫警卫、皇帝的安全以及侦查和缉捕反叛者。
随着时间的推移，特别是在明成祖朱棣之后，东厂的权力逐渐扩大，有时甚至超越了锦衣卫，特别是在魏忠贤等大太监掌权时期。
总结来说，在明朝中后期，东厂的权力普遍大于锦衣卫。东厂由于其与皇帝的直接联系和宦官领导的特点，在多数时期拥有更多的权力和影响力