镇元子不拜三清的原因主要有以下几点：
地仙之祖的自信与自尊：
镇元子作为地仙之祖，法力高强，实力远超许多天仙，但他对仙界的地位感到不满。他认为自己虽然地位崇高，但并不被其他神仙（如三清）所重视，因此产生了一种酸葡萄心理，不愿意向他们表示尊敬。
与三清的关系：
镇元子认为三清是他的朋友（清风明月语），既然是朋友，就没有必要行拜礼。这种态度反映了他对自己地位的自信和对传统礼节的蔑视。
不求人：
镇元子认为自己有着足够的法力和能力，不需要依靠三清的庇护或提拔，因此他选择不拜三清，保持自己的独立性和自尊。
辈分与实力：
镇元子认为自己的辈分和实力足以与三清平起平坐，甚至不将玉帝放在眼里。他觉得自己有足够的资格不拜三清，这种态度体现了他的骄傲和不屈。
综上所述，镇元子不拜三清的原因主要是出于对自己实力和地位的自信，以及对传统礼节的蔑视。他认为自己作为地仙之祖，有足够的资格不向三清行拜礼，因此选择了保持自己的独立性和自尊。