三证合一后，企业通常需要办理以下手续：
变更登记手续
到当地工商局进行变更登记，将原有的三证信息合并，并领取新的统一社会信用代码证书。
印章更换
重新制作新的公章、财务专用章、法人章等，以适应新的统一社会信用代码。
纳税信息变更
与税务机关联系，更新企业的税务信息，确保纳税信息与新的统一社会信用代码一致。
银行信息变更
到开户银行申请终止旧的“税银联网三方协议”，然后办理税号变更，并重新签署新的协议。
税务数字（CA）证书更换
如有需要，到服务商处重新办理CA数字证书。
税控设备变更发行
作废手中全部发票，确保开票系统数据上传成功，并在网上办税服务厅重新发行开票系统。
其他相关手续
根据业务需要，可能还需办理其他类型的税务登记证，如增值税一般纳税人资格证等，以及特定行业许可证。
请注意，以上流程可能因地区或具体情况有所不同，建议咨询当地工商和税务部门获取最新信息