当两个人互相喜欢却不能在一起时，可能的原因包括但不限于以下几点：
时机不对
可能因为一方已有稳定关系，或工作、学业等问题导致两人不能在同一地方。
两人的感情可能未升华到一定程度，错过了最佳发展时机。
性格不符
性格差异可能导致交流不畅和相处不适应，影响感情发展。
距离遥远
长距离恋爱中，两人若不能保持经常联系，感情可能会逐渐淡化。
价值观和理想不同
如果两人的生活目标和人生追求不一致，难以长期默契相处。
经济基础
爱情需要物质生活的支撑，经济能力不足可能导致感情不稳定。
家庭因素
对方家庭的意见或反对，以及家庭背景差异可能影响两人的关系。
心理和沟通问题
性格不兼容、想法和价值观的差异可能导致冲突。
缺乏有效沟通，无法理解对方感受，可能积累误会。
现实压力
工作不稳定、经济基础薄弱等现实问题可能影响感情发展。
缘分和时机
生活轨迹、人生阶段、家庭环境等可能影响两人在一起的时机。
其他不可预测因素
有时候，即使两人互相喜欢，也可能因为其他不可预测的原因无法在一起。
当面对这样的情感困境时，重要的是学会接受现实，理解每个人和每段关系都有其独特的挑战和限制。有时候，即使心中有遗憾，放手也许是对自己和对方最好的选择。