盐酸通常被认为在除垢能力上比草酸强，因为盐酸是无机强酸，在水中完全电离，其除垢去污能力是草酸的1000倍以上。盐酸能够迅速分解金属表面的氧化物，如铁锈，并且可以用于清洁锅炉、管道及冷却系统等设备，去除沉积物和污垢。然而，盐酸具有强腐蚀性，使用时需要格外小心，并采取适当的安全防护措施。
草酸虽然除垢能力相对较弱，但它是有机酸，对某些垢类物质，如金属离子形成的垢，有较强的去除能力，并且腐蚀性较小，使用时相对安全。草酸在去除由有机物和酸性物质形成的水垢时表现较好，且具有抗菌效果，避免细菌滋生。
总结来说，盐酸在除垢能力上优于草酸，但考虑到安全性和对设备的潜在腐蚀性，使用时需谨慎。草酸虽然除垢能力稍弱，但具有较低的腐蚀性和较好的安全性。选择哪种酸进行除垢应根据垢的具体类型和清洗对象的安全要求来决定