矮化苹果苗的选择取决于多个因素，包括品种特性、适应性、产量、品质、管理难度以及市场需求等。以下是一些被广泛认为优良的矮化苹果苗品种：
烟富系列
烟富8号：在郓城县广泛栽植，具有高桩、果大、味甜、色艳、品质优、产量高等特点，适合矮化密植栽培。
烟富0（烟富10）：使用矮化砧木嫁接，节约土地，适合密植栽种，果实着色好，含糖量高。
其他品种
鲁丽、秦脆、秦蜜：这些都是适应能力很强的苹果品种。
维纳斯黄金、红嘎啦、王林、宫美富士：传统优秀品种，适应能力强。
藤牧一号、信浓红、嘎啦、中秋王、蜜脆、斗南红提、维多利亚、红乳、科瑞森、森田尼无核、玫瑰红提：适合北方栽培的品种。
矮化爱妃：晚熟品种，口感香甜，外观美观，营养价值高，种植容易。
选择矮化苹果苗时，应考虑当地气候条件、栽培技术和管理能力。同时，选择纯度高、经济效益高的品种会更加有利于生产。