股权纠纷案件的处理方式多样，主要包括以下几种：
协商和解
双方当事人应首先尝试通过友好协商解决问题。在协商过程中，双方可以就争议点进行深入讨论，并寻求双方都能接受的解决方案。协商是最快且成本最低的方式，因为双方可以直接沟通，寻找共同点，以达成和解。
调解解决
如果协商未能达成一致，可以考虑邀请双方信任的第三方进行调解。这个第三方可以是行业协会、专业调解机构或者双方共同认可的个人。调解过程中，调解员会协助双方梳理争议点，并提出建议性的解决方案，以促成双方和解。
仲裁解决
如果协商和调解均未能解决问题，且股权协议中包含了仲裁条款或者双方事后达成了书面仲裁协议，那么可以向约定的仲裁机构申请仲裁。仲裁裁决具有法律效力，双方必须履行。仲裁程序相对简单快捷，且一裁终局，有助于迅速解决纠纷。
诉讼解决
当协商、调解和仲裁均无法解决问题时，任何一方都可以向人民法院提起诉讼。诉讼程序虽然较为繁琐和时间成本较高，但它具有强制执行力，可以确保纠纷得到最终解决。
法律依据及注意事项
在处理股权转让纠纷时，应依据《中华人民共和国公司法》、《中华人民共和国合同法》等相关法律法规进行。在法院调解或仲裁过程中，应遵循《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，如调解协议的内容不得违反法律规定，且调解达成协议必须双方自愿，不得强迫。
建议
尽量协商：首先尝试通过协商解决问题，因为这是最快且成本最低的方式。
选择合适的调解机构：如果协商无果，可以选择专业的调解机构进行调解，以中立的角度协助双方达成共识。
注意仲裁条款：在签订股权协议时，应明确约定仲裁条款，以便在纠纷发生时有明确的解决途径。
及时诉讼：如果协商、调解和仲裁均无法解决问题，应及时向人民法院提起诉讼，以维护自身权益。
希望以上信息能对您有所帮助。