南京的卡子门地区实际上 同时属于秦淮区和雨花台区，具体情况如下：
秦淮区
卡子门因清代收货物税在此设卡而得名，因此得名“卡子门”.
卡子门大街及其周边地区，如金陵美术馆、蒋百万故居、惜抱轩等景点均位于秦淮区.
卡子门站是南京地铁3号线的车站，也位于秦淮区晨光路与明匙路交叉路口西侧卡子门世纪广场绿地内.
雨花台区
卡子门大街现泛指雨花东路、卡子门大街、晨光路、雨花南路交会处及世纪广场周围一带区域，这一区域也属于雨花台区.
卡子门地铁站位于雨花台区，是地铁3号线和10号线二期的换乘站.
因此，卡子门地区是一个跨越秦淮区和雨花台区的地理位置，具体归属需要根据使用场景和具体需求来区分。如果需要游览景点或乘坐地铁，则秦淮区是主要区域；如果关注街道和日常生活设施，则雨花台区更为相关。