灵族消失的原因主要有以下几种可能：
被魂族所灭
灵族早早地被魂族所灭，陀舍古帝玉也被夺走。灵族之人已经全部被虚无吞炎吞噬消失了，因此最后落得个关闭山门，消息全无的下场。
修炼方式不适应时代发展
灵族可能因为主修灵魂，族中修炼方式没有适应时代发展，导致人才逐渐凋零，从而被魂族所灭。
血脉之力过于强大
在某些小说设定中，灵族消失的原因是因为他们的血脉之力过于强大，引起了其他种族的嫉妒和恐惧。
整体实力不足
虽然灵族和石族在远古八族中有一定地位，但整体实力可能不如其他族群，如魂族，最终被魂族轻易灭掉。
陀舍古帝玉的争夺
魂天帝千年前就觊觎陀舍古帝玉并开始布局，作为斗帝血脉较为稀疏的灵族成了目标，整个灵族被魂族所灭，陀舍古帝玉落入魂天帝手中。
综合以上信息，灵族消失的原因是多方面的，包括被魂族所灭、修炼方式不适应时代发展、血脉之力强大引发的嫉妒和恐惧、整体实力不足以及陀舍古帝玉的争夺等。这些因素共同作用，最终导致了灵族的消失。