撰写双方合作协议时，应当遵循以下基本结构和内容要点：
合作协议书的基本结构
标题 ：明确标明文档性质，如“双方合作协议书”。合作双方信息
甲方：全称、地址、法定代表人或负责人、联系方式。
乙方：全称、地址、法定代表人或负责人、联系方式。
合作宗旨：
阐述双方合作的目的和期望达到的目标。
合作范围：
明确合作的具体领域、项目或产品。
合作期限：
合作开始和结束的时间。
出资额、方式、期限
（如适用）：
出资方的出资额、出资方式、出资时间。
出资额的总计以及合伙期间共有财产的处理方式。
盈余分配与债务承担 盈余的分配比例和方法。 债务的承担方式和比例。 甲方的权利和义务。 乙方的权利和义务。 违反协议条款时应承担的责任和后果。 争议解决的方式，如协商、调解、仲裁或诉讼。 保密条款、不可抗力条款等。 协议签订的日期和地点。 附件双方权利和义务
违约责任
争议解决
其他条款
签署日期和地点
相关文件、资料等。
示例内容
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双方合作协议书
甲方：__________
乙方：__________
鉴于甲乙双方本着诚信合作、平等互利的原则，经友好协商，就合作事宜达成如下协议：
第一条 合作范围
甲方同意将__________项目委托给乙方进行合作。
第二条 合作期限
合作期限自____年____月____日起至____年____月____日止。
第三条 出资额、方式、期限
甲方出资人民币____元，乙方出资人民币____元。
第四条 盈余分配与债务承担
盈余按照甲方____%、乙方____%的比例分配。
债务由双方按照出资比例共同承担。
第五条 双方权利和义务
甲方负责提供项目相关资料，乙方负责具体执行项目工作。
第六条 违约责任
如一方违约，应承担相应的经济损失赔偿责任。
第七条 争议解决
双方应通过友好协商解决争议，协商不成时可提交____仲裁委员会仲裁。
第八条 其他
本协议一式两份，甲乙双方各执一份，自签字盖章之日起生效。
甲方（盖章）：__________
乙方（盖章）：__________
签订日期：____年____月____日
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请根据具体合作内容和实际情况调整上述模板内容。在签订正式合作协议之前，建议咨询专业律师或法律顾问进行审核，以确保协议的合法性和有效性