公司确实可以在特定情况下起诉员工。以下是可能的情况：
劳动争议：
当公司和员工之间发生争议，如工资、工作时间、解雇等问题，且协商不成时，员工或公司可以向劳动仲裁委员会申请仲裁。如果对仲裁结果不满意，任何一方都可以在法定期限内向人民法院提起诉讼。
违反合同或规章制度：
如果员工违反了劳动合同或公司的规章制度，例如旷工，公司可能要求员工赔偿损失或采取其他法律行动。
其他民事纠纷：
公司和员工之间也可能发生其他类型的民事纠纷，如知识产权侵权、合同纠纷等，在这些情况下，公司可以像对待任何其他民事纠纷一样起诉员工。
需要注意的是，劳动争议通常有仲裁前置的要求，即必须先经过劳动仲裁程序，然后才能向人民法院提起诉讼。此外，根据《公司法》，公司的债务应由公司以其全部财产承担，员工通常不对公司的债务承担连带偿还责任。