保变电气在2016年确实进行了重组。根据提供的信息，2016年9月1日，保变电气发布了关于控股股东可能发生变更的公告。公告中提到，公司的控股股东中国兵器装备集团有限公司（兵器装备集团）正在与中国电气装备集团有限公司（中国电气装备）进行输变电装备业务的整合事宜。这表明保变电气的控股股东可能会从兵器装备集团变更为中国电气装备。
然而，重组方案当时还处于筹划阶段，并且需要履行内部决策程序以及获得相关主管部门的批准，因此整合存在不确定性。这一消息发布后，保变电气的股价出现了异常波动，投资者被建议对此类重组事项保持谨慎态度。