多巴新城的搬迁涉及了以下村庄：
黑嘴尔村：
黑嘴尔村是多巴新城推进城市更新的重要区域，已经进行了整村拆迁。
城中：
城中的拆迁工作也在进行中，以改善城市面貌。
城西：
城西同样在进行整村拆迁。
王家庄：
在多巴镇国道109线昆仑西路改线工程建设项目中，王家庄的村民进行了搬迁安置。
大掌村：
大掌村有300户人家已经入住新的安置房。
北沟村：
北沟村也有部分村民已经入住新的安置房。
甘河门村：
甘河门村因南绕城高速项目进行了拆迁，并有41户农户得到了安置。
这些村庄的搬迁工作是为了推进多巴新城的城市更新和开发建设，确保失地农民的生活得到妥善安置。建议关注官方公告和通知，以获取最新的搬迁进展和相关信息。