旷工扣工资的方式如下：
按事假处理：
旷工只能按事假处理，即当天无工资，不得有额外罚款。旷工当天没有工资，不能旷一天罚三天等做法是违法的。
赔偿损失：
如果旷工给单位造成损失，单位可以要求旷工员工赔偿。赔偿金额可以从劳动者的工资中扣除，但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。
解除劳动合同：
如果旷工天数达到公司规定的解除劳动合同的标准，单位可以解除劳动合同。
规章制度：
用人单位可以根据劳动合同的约定和自身的规章制度来规定旷工的扣工资方式。但需要注意的是，企业罚款权在司法实践中存在争议，一些观点认为企业没有罚款权，旷工只能扣当天工资。
综上所述，旷工扣工资主要是按事假处理，当天无工资，不得额外罚款。若旷工给单位造成损失，单位可以要求赔偿，但赔偿额度有限制。严重旷工可能导致解除劳动合同。具体扣工资方式需参照用人单位的规章制度和劳动合同约定。